Dušan Uhrin. První trenér samostatné české reprezentace, k týmu nastoupil po rozpadu federace na jaře 1993, byť společný tým Čechů a Slováků pdo vedením Václava Ježka ještě dohrával kvalifikaci o mistrovství světa 1994. Remíza v posledním utkání v Belgii šance na šampionát v USA vzala.
Jozef Chovanec. Jeho předchůdce Uhrin získal stříbro na Euru 1996, ale v následující kvalifikaci o MS 1998 ve Francii tým pohořel. Šéf svazu Chvalovský za Uhrinova nástupce vybral muže, který byl trenérem necelý rok a půl, což u odborné veřejnosti i fanoušků vzbuzovalo nedůvěru. Chovanec však měl se Spartou skvělé výsledky. Z posledního místa dovedl tým k titulu a pak jako první postoupil z kvalifikace do Ligy mistrů.
Jozef Chovanec (vpravo) a Karel Brückner během baráže v Belgii.
Karel Brückner. Krach v bojích o mistrovství světa a následuje další změna. Chovanec jako první trenér na světě sice vyhrál kvalifikaci bez ztráty bodu, na Euru 2000 nepostoupil ze silné skupiny a následně ani na MS 2002. Po zpackané baráži s Belgií na podzim 2001 skončil. Jeho dosavadní asistent Brückner nebyl mezi čtyřmi adepty favoritem, ale nakonec vyhrál.
Jeho konkurenti Jozef Jarabinský i Vlastimil Petržela se ještě před volbou kandidatury vzdali, výkonný výbor pak dal přednost Brücknerovi před Ladislavem Škorpilem. Brückner s týmem postoupil na všechny šampionáty, o něž hrál. Na Euru 2004 byl třetí, pak jako první kouč po šestnácti letech dovedl reprezentaci na MS. Po Euru 2008 od národního týmu odešel z vlastní vůle.
Petr Rada
Petr Rada. Brücknerův asistent se sice poroučel se svým nadřízeným a pokračoval v angažmá v Teplicích, ale než se rozjela podzimní sezona, byl zvolen novým trenérem reprezentace. V tajném hlasování členů výkonného výboru porazil Jozefa Chovance, kterého prosazoval vlivný Vlastimil Košťál, oficiálně místopředseda, fakticky však první muž svazu. Poté se z českého fotbalu do půl roku vytratil.
František Straka. Prokletá kvalifikace o mistrovství světa nešla týmu ani pod Radou, neuspokojivé výsledky i flám některých hráčů po domácí porážce se Slovenskem přispěly na jaře 2009 k jeho odvolání. Jelikož se blížila volební valná hromada, nový trenér Straka měl mandát jen pro červnový duel s Maltou. Straka dostal přednost před Uhrinem, kterého navrhla expertní komise a on už s funkcí počítal.
František Straka
Ivan Hašek. Bývalý reprezentant ukončil angažmá ve Spojených arabských emirátech a na valné hromadě se stal předsedou svazu. Jelikož jeho kandidát na reprezentačního trenéra Karel Jarolím nabídku odmítl, tak se koučem jmenoval sám Hašek. Mužstvo vedl v kvalifikaci o MS 2010 ve zbývajících čtyřech zápasech, dvě výhry a dvě remízy však nestačily ani na baráž. Za svého nástupce vybral asistenta Michala Bílka, což mu výkonný výbor schválil.
Michal Bílek. Ještě než udělal svou první nominaci, čelil negativním reakcím veřejnosti. Ta mu vyčítala, že se trenérem stal jen proto, že je Haškův kamarád. Bílkovi se pak nepovedla první akce, přípravný turnaj s Emirátech, kde měl ligový výběr, a nálada proti němu se stupňovala. Nezlepšila se ani po postupu na Euro 2012 a účasti ve čtvrtfinále. Když v následné kvalifikaci o MS 2014 tým ztratil reálnou naději na postup, kouč rezignoval.
Josef Pešice. Provizorní kouč po Bílkovi, jemuž dělal asistenta. Dopředu věděl, že povede tým jen do konce roku 2013.
Pavel Vrba. Má za sebou vynikající výsledky v Plzni. Přichází po neúspěšné kvalifikaci o světový šampionát. Má výraznou podporu předsedy asociace i fotbalového národa.
