Po podzimní části udržel kontakt s oběma týmy víceméně pouze Xaverov, po 20. kole se ale největší uchazeči o dvě postupová místa od zbylých týmů již jasně oddělili.
Opava se o patro níže ocitla po nevydařeném ročníku 1999/2000, po pětiletém účinkování mezi elitou. Její tragický osud se začal naplňovat ve 20. kole, kdy byl po podzimu pro neuspokojivé výsledky odvolán trenér Jiří Bartl. Na lavičce ho vystřídal Petr Uličný, i on však hledal recept na vítězství velmi těžko. V neuvěřitelně vyrovnané soutěži nakonec Opava nedokázala zužitkovat příznivý los a v jejím závěru naprosto selhala.
Po domácích porážkách s Žižkovem a Příbramí pohřbila svou poslední naději v závěrečném kole vysokou prohrou na hřišti Jablonce v přímém souboji o záchranu.
Akutní hrozba sestupu přitom před opavskými fotbalisty stála už v ročníku 1998/99, tehdy si ale ještě ligovou příslušnost klub uchoval. K potřebné remíze v závěrečném kole v utkání s Ostravou hnal domácí hráče vyprodaný patnáctitisícový stadión v Městských sadech.
Na kritickou situaci reagovalo vedení Opavy tak, že na předchozí důležitý zápas v Příbrami vypravilo několik autobusů s fanoušky. Náklady hradili ze svých prémií hráči a trenéři.
Historickým úspěchem klubu, hrajícím pod nynějším názvem od sezóny 1998/99, byl postup do první ligy v ročníku 1994/95. Hned v první prvoligové sezóně se Opava umístila šestá, což je její nejlepší výsledek. Poté měla výkonnost mužstva jen sestupnou tendenci. Ročník 1996/97 zakončili opavští hráči devátí, posléze jedenáctí a dále měli jen záchranářské práce.
Během svého působení mezi nejlepší českou šestnáctkou klubů proslula Opava svou skvělou domácí diváckou kulisou, v ochozech stadiónu se pravidelně tísnilo zhruba 10.000 lidí. V sezóně 1998/99 měl klub průměrnou domácí návštěvu ve výši 11.355 diváků. Sestup do druhé ligy byl pro vyhlášenou fotbalovou baštu v zemi o to větším zklamáním.